Акацука родился в Маньчжурии 14 сентября 1935 года. После Второй мировой войны они с матерью переехали в Японию. Вырос Акацука в префектурах Ниигата и Нара. В 19 лет переехал в Токио.
В свободное от работы на химическом заводе время, он рисовал много манги. Он начал свою карьеру в качестве сёдзё-мангаки, но после того, как в 1958 году его «Нама-тян» (яп. ナマちゃん) стала хитом, он стал специализироваться на комедийной манге.
Акацука получил в 1964 году Премию манги Shogakukan за «Осомацу-кун», а в 1971 году Премию манги Bungeishunjū за “Tensai Bakabon”. Говорят, что на него оказали влияние Бастер Китон и журнал MAD.
В 2000 году он нарисовал мангу шрифтом Брайля.
С апреля 2002 года до своей смерти он был прикован к постели из-за внутримозгового кровоизлияния. Акацука Фудзио скончался 2 августа 2008 года от пневмонии в больнице района Бункё, Токио.